حجت الاسلام جعفر شجونی متولد ۱۳۱۱ در شهرستان فومن، از همراهان نواب صفوی در دوران مبارزه با حکومت پهلوی بود و در دوره نخست مجلس شورای اسلامی نیز نماینده مردم کرج در پارلمان به شمار می رفت. وی از عصر روز شنبه به دلیل عارضه قلبی و کاهش قند خون در بیمارستان فیروزگر بستری شده بودند که صبح روز یکشنبه دار فانی را وداع گفتند.

با تسلیت درگذشت مرحوم حجت‌الاسلام والمسلمین حاج شیخ جعفر شجونی، ‏از ‏درگاه ایزد منان برای آن مرحوم رحمت واسعه الهی و برای عموم بازماندگان صبر و اجر مسألت می کنیم. حضرت آیت الله خامنه‌ای رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی درگذشت روحانی مبارز و آزاده جناب حجة‌الاسلام آقای حاج شیخ جعفر شجونی را تسلیت گفتند.
متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به این شرح است:

بسمه تعالی

با تأسف فراوان خبر درگذشت روحانی مبارز و آزاده جناب حجة‌الاسلام آقای حاج شیخ جعفر شجونی را دریافت کردم. آن مرحوم از مبارزان دیرین با رژیم طاغوت و از وفاداران به امام و انقلاب و نظام مقدس جمهوری اسلامی در سراسر عمر تبلیغی خود بود. منبرهای روشنگر و بیان صریح و شیرین او خاطره‌های ماندگاری در ذهن و دل آشنایان این روحانی شجاع بر جای گذاشته است.
از خداوند متعال غفران و رحمت برای آن مرحوم و صبر و اجر برای بازماندگانشان مسألت می‌کنم.

سیّد علی خامنه‌ای
۱۷/آبان/۱۳۹۵