بازدید:38290   بروزرسانی: 20-12-1402

Publications in Journals

  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
16.  Behnam Aghajan, Mohammadreza Ghaemi, Ali mohammadian mosamam, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
A systems biology approach to find representative genes in Acute Myeloid Leukemia
یک راهکار مبتنی بر زیست شناسی سامانه ای جهت یافتن ژنهای دخیل در سرطان لوسمی حاد میلوئیدی
PLoS One Issue - (2026-07-27) PP. 1-19 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
15.  Behnam Aghajan, Mohammadreza Ghaemi, Ali mohammadian mosamam, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
A novel multi-objective optimization framework using NSGA-II for gene co-expression network inference
یک چارچوب نوین بهینه سازی چند هدفه با بکارگیری الگوریتم NSGA-II به عنوان رابط شبکه هم‌بیانی ژن
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY Issue (108944) 122 (2026-02-08) PP. 1-11 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
14.  Kobra Rahmati, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
Dynamic Behavior and Ligand Binding Properties of the Wild Type Deoxycytidine Kinase and its Characterized Gemcitabine-Resistant Variant: A Bioinformatics and Computational Study
رفتار دینامیکی و ویژگی‌های اتصال به لیگاند در گونه وحشی دزوکسیتیدین کیناز و نسخه مقاوم به جمسیتابین آن: یک مطالعه محاسباتی و بیوانفورماتیکی
Journal of Computational Biophysics and Chemistry Issue 23 (2024-12-29) PP. 25-34 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
13.  Saba Habibi, Mohammad Yaghoubzad Maleki, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
Effects of representative point mutations on dynamic behavior of the DISC1–Ndel1 complex: a molecular dynamics study
اثرات جهش‌های نقطه‌ای خاص بر روی رفتار دینامیکی کمپلکس DISC1-Ndel1: مطالعه ای مبتنی بر دینامیک ملکولی
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS Issue (22) 41 (2023-03-01) PP. 13228-13234 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
12.  Mohammad Yaghoubzad Maleki, Saba Habibi, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
Bioinformatics and Molecular Dynamics Studies on the Human DISC1 in Complex with the Ndel1
مطالعات بیوانفورماتیک و شبیه‌سازی دینامیک ملکولی بر روی پروتپین disc1 انسانی در کمپلکس با Ndel1
Journal of Computational Biophysics and Chemistry Issue (2) 22 (2023-01-05) PP. 147-156 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
11.  Elahe Karimi, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
Evolutionary adaptation of DHFR via expression of enzyme isoforms with various binding properties and dynamics behavior: a bioinformatics and computational study
سازگاری تکاملی آنزیم دی‌هیدروفولات ردوکتاز از طریق بیان ایزوفرم‌های آنزیمی با ویژگی‌های اتصالی و رفتار دینامیکی متفاوت: یک مطالعه بیوانفورماتیکی و محاسباتی
BIOLOGICAL CHEMISTRY Issue (7)403 (2022-12-15) PP. 643-652 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
10.  Haniyeh Moghadasi, Soghra Rezayi, Amir Hossein Darooneh, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
A comparative analysis of dipeptides distribution in eukaryotes and prokaryotes by statistical mechanics
تجزیه و تحلیل مقایسه‌ای توزیع دی‌پپتیدها در پروکاریوت‌ها و یوکاریوت‌ها با استفاده از روش‌های مکانیک آماری
PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS Issue 555 (2020-10-01) PP. 124567-1-124567-7 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
9.  Maryam Malekzadeh, Emran Heshmati, Farideh Badalkhani Khamseh, Sayed Ali nojomi
Investigation of conformational structures of gemcitabine and its 2′,2′- difluoro 2′-deoxy derivatives: A computational study
بررسی ساختارهای کنفورماسیونی جمسیتابین و مشتقات 2′,2′-دی‌فلورو 2′دئوکسی: مطالعه محاسباتی
Computational and Theoretical Chemistry Issue ۱۱۷۷ (2020-01-15) PP. ۱-۶ 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
8.  Himan mohammadi nezhad, Alireza Beyramzadeh, Muhammad Shadman, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
Temperature dependent dynamics in highly homologous adenylate kinases
دینامیک وابسته به دما در آدنیلات کینازهای با شباهت بالا
JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS Issue 37 (2019-04-08) PP. 2110-2117 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
7.  - -, Emran Heshmati, Khosrow Khalifeh
Distribution of dipeptides in different protein structural classes: an effort to find new similarities
توزیع دی‌پپتیدها در کلاس‌های مختلف ساختاری پروتئینی: تلاشی در جهت یافتن شباهت‌های جدید
EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS Issue 47 (2017-12-29) PP. 31-38 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
6.  - -, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
Neighbor effect and local conformation in protein structures
اثر همسایگی و پیکربندی موضعی در پروتئین‌ها
AMINO ACIDS Issue 49 (2017-07-12) PP. 1641-1646 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
5.  Elaheh Astani, Emran Heshmati, -- --, Hadipour naser
A theoretical study on the characteristics of the intermolecular interactions in the active site of human androsterone sulphotransferase: DFT calculations of NQR and NMR parameters and QTAIM analysis
بررسی نظری ویژگی های برهمکنش بین مولکولی در جایگاه فعال آندسترن سولفوتراسفراز انسانی: محاسبات DFT پارامترهای NQR و NMR و نحلیل QTIME
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING Issue 68 (2016-06-08) PP. 14-22 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
4.  Elaheh Astani, Emran Heshmati, -- --, Hadipour naser, Setareh shekarsaraei
A study of hydrogen bond effects on the oxygen, nitrogen, and hydrogen electric field gradient tensors in the active site of human dehydroepiand
بررسی اثرات پیوند هیدروژنی بر تانسورهای شیب میدان الکتریکی ناشی از اکسیژن، نیتروژن و هیدروژن موجود در جایگاه فعال دهیدرواپی اندسترون سولفو تراسفراز انسانی: مطالعه ای مبتنی بر نظریه تابعیت چگالی
CHEMICAL PHYSICS LETTERS Issue 653 (2016-04-02) PP. 78-84 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
3.  Elaheh Astani, Emran Heshmati, -- --, Hadipour naser, Setareh shekarsaraei
Noncovalent intermolecular interactions between dehydroepiandrosterone and the active site of human dehydroepiandrosterone sulphotransferase: A density functionaltheory based treatment
بررسی برهمکنش های بین مولکولی در جایگاه فعال دی هیدرو اپی آندروسترون سولفوترانسفراز انسانی:
CHEMICAL PHYSICS LETTERS Issue 649 (2016-01-23) PP. 123-129 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
2.  Emran Heshmati, Mozdorani Hossein, Abdolmaleki parviz, Khoshaman kazem
Radiosensitizing effects of gemcitabine on aerobic and chronically hypoxic HeLa and MRC5 cells in-vitro
اثرهای حساسیت پرتوی جمسیتابین بر
IRANIAN JOURNAL OF RADIATION RESEARCH Issue 10 (2012-06-01) PP. 11-18 
  علمی-پژوهشی
ISI-JCR
1.  Emran Heshmati, Abdolmaleki parviz, Mozdorani Hossein, Sabet Sarvestani Amir
Effects of halogen substitution on Watson–Crick base pairing: A possible mechanism for radiosensitivity
اثرهای استخلاف هالون بر جفت بازهای واتسون-کریکی: مکانیسمی احتمالی برای حساسیت پرتوی
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS Issue 19 (2009-06-18) PP. 5256-5260 


Presentations in Seminars & Conferences


ملی معتبر 15. فاطمه افشارلو, یعقوب پاژنگ, خسرو خلیفه, نادر نوروزی پسیان, عمران حشمتی
میانکنش بوسولفان با آلبومین سرم گاوری: مطالعات محاسباتی و آزمایشگاهی
Interaction of Busulfan with Bovine Serum Albumin: An Experimental and Computational Studies
کنفرانس ملی علوم پروتئینی و پپتیدی دانشگاه شهید بهشتی, تهران, 1404/08/28 - 1404/08/29
بین‌المللی 14. Ali Eyvazi, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
بررسی بیوانفورماتیکی و محاسباتی پروتئین حفاظت‌شده نوکلئوکلسین
Bioinformatics and computational Studies on Highly Conserved Neurocalcin Protein
International Conference on Bioinformatics of Iran انجمن بیوانفورماتیک ایران, زنجان, 2025-02-04 - 2025-02-06
ملی معتبر 13. Khosrow Khalifeh, Mohammadreza Ghaemi, Emran Heshmati, Behnam Aghajan
یک رویکرد مبتنی بر نظریه گراف برای آنالیز تشابه داده ها DNA
A graph theory based approach for DNA sequence similarity analysis
Annual Iranian Mathematics Conference دانشگاه زنجان, زنجان, 2023-08-23 - 2023-08-25
ملی معتبر 12. Khosrow Khalifeh, Mohammadreza Ghaemi, Emran Heshmati, Behnam Aghajan
یک رویکرد مبتنی بر نظریۀ گراف برای آنالیز تشابه دنبالۀ DNA
A graph theory based approach for DNA sequence similarity analysis
Annual Iranian Mathematics Conference دانشگاه زنجان, زنجان, 2023-08-23 - 2023-08-25
ملی معتبر 11. خسرو خلیفه, محمدرضا قائمی, عمران حشمتی, بهنام آقاجان
تحلیل آماری داده های ریز آرایه‌ای سرطان خون حاد ملوئیدی و ارتباط آن با بیماری سل
.
همایش ملی ریاضیات زیستی دانشگاه مازندران, بابلسر, 1401/11/19 - 1401/11/21
ملی معتبر 10. سمانه فضلی, زهرا رستمی, نرگس بدری, خسرو خلیفه, عمران حشمتی
ترجیح دی‌پپتیدها برای پذیرش پیکربندی مارپیچی
Preference of dipeptides for adopting helix conformation
همایش بیوانفورماتیک ایران دانشگاه تربیت مدرس, تهران, 1396/10/13 - 1396/10/15
بین‌المللی 9. Emran Heshmati, Amir Hossein fathi navid, Khosrow Khalifeh
پارس2: بسته نرم‌افزاری R برای مشخصه‌بندی ساختار دوم پروتئین‌ها
PARA2: an R package for Protein Assignment Regarding Secondary Structure
international conference communication, Internet, and Information Technology The National Academy of Science of Armenia The Institute for Informatics and Automation Problems, Armenia, 2017-09-25 - 2017-09-25
ملی معتبر 8. Seyedeh Bahareh Shokri, Khosrow Khalifeh, Morteza Vahedpour, Emran Heshmati
تعیین کننده های اتمی برای القاء کانفرمر β در ساختار پروتئین
Atomic determinants for inducing β conformation in protein structure
Iranian Physical Chemistry Seminar دانشگاه اراک, اراک, 2017-08-20 - 2017-08-22
بین‌المللی 7. شبنم رضایی, راحله شاهان, خسرو خلیفه, عمران حشمتی
اهمیت برهم کنش واندروالس در یکپارچگی ساختاری پروتئین های بزرگ
The importance of Van der Waals interaction on retaining the structural integrity of large-sized proteins
کنگره ملی و کنگره بین المللی زیست شناسی ایران دانشگاه تبریز, تبریز, 1395/06/09 - 1395/06/11
بین‌المللی 6. مهین قدیمی, عمران حشمتی, خسرو خلیفه
آیا در فراوانی دی‌پپتیدها بر اساس ساختار پروتئین نظم خاصی وجود دارد؟
Is there any regularity in dipeptide frequency according to structural class of proteins?
کنگره بین المللی و کنگره ملی ژنتیک ایران انجمن ژنتیک ایران, تهران, 1395/03/01 - 1395/03/03
بین‌المللی 5. امیر حسین فتحی نوید, عمران حشمتی, خسرو خلیفه
توسعه یک نرم‌افزار برای مشخصه‌بندی پروتئین بر اساس عناصر ساختار دوم
Development a Software for Protein Assignment based on Secondary Structure
کنگره بین المللی و کنگره ملی ژنتیک ایران انجمن ژنتیک ایران, تهران, 1395/01/01 - 1395/01/03
ملی معتبر 4. عمران حشمتی, الهه آستانی
روش های DFT-D با چه دقتی می توانند ساختار و انرزتیک پروتیین ها را پیشگویی کنند؟
How well can DFT-D methods predict protein geometries and energetics?
کنفرانس ملی علوم پروتئینی و پیتیدی از پایه تا کاربردهای پزشکی و صنعتی دانشگاه شیراز, شیراز, 1393/09/19 - 1393/09/20
ملی معتبر 3. الهه آستانی, عمران حشمتی, هادی پور ناصر
محاسبه ی اندرکنش های غیر کووالان در جایگاه فعال آنزیم هیدروکسی استرویید سولفوترانسفراز با استفاده از روشهای DFT
Calculations of non-covalent interactions in the active site of hydroxysteroid sulfotransferase enzyme using DFT method
کنفرانس ملی علوم پروتئینی و پیتیدی از پایه تا کاربردهای پزشکی و صنعتی دانشگاه شیراز, شیراز, 1393/09/19 - 1393/09/20
بین‌المللی 2. Parisa ghanavatian, Samira Daviran, vahab jafarian, Khosrow Khalifeh, Emran Heshmati
بررسی نقش جهش A19D در ساختار و عملکرد پروتئین شیرین کننده برازئین
Investigation the role of A19D mutation on the structure and function of sweet- tasting Brazzein
International Conference of Biology دانشگاه خوارزمی, کرج, 2014-08-26 - 2014-08-29
بین‌المللی 1. Samira Daviran, Parisa ghanavatian, vahab jafarian, Emran Heshmati, Leila Hassani
بررسی افزایش بیان پروتئین مهندسی شده متالوتیونین در سویه های مختلف باکتری ها
Investigation of over expression of engineered metallothionein protein in different Bacterial strains
International Conference of Biology دانشگاه خوارزمی, کرج, 2014-08-26 - 2014-08-29